######################################## # Program: pepdigest # Rundate: Wed 20 Jun 2018 11:53:43 # Commandline: pepdigest # [-seqall] ami/SAVERM_1029.fasta # -menu 2 # -mono # -allpartials # -mono # -outfile digest_db/SAVERM_1029.db # Report_format: seqtable # Report_file: digest_db/SAVERM_1029.db ######################################## #======================================= # # Sequence: SAVERM_1029 from: 1 to: 318 # HitCount: 11 # # Complete digestion with Lys-C yields 11 fragments # #======================================= Start End Mol_Weight Cterm Nterm Sequence 170 255 9460.126 K D MGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLK 71 135 7047.617 K F TQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAK 256 305 5421.988 K Y DPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQK 42 70 3149.920 K T RSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATK 142 169 2831.613 K M RAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSK 1 24 2333.106 . G MSSTSSPVTTDSQPASVPATGPTK 306 317 1265.640 K E YWQSGLAAGSVK 25 34 1150.705 K H GAPRLRTPRK 35 41 789.461 K R HVPGRPK 136 141 695.364 K R FTFPGK 318 318 147.053 K . E #--------------------------------------- #--------------------------------------- #======================================= # # Sequence: SAVERM_1029 from: 1 to: 318 # HitCount: 54 # # # # Partial digest with Lys-C yields 54 extras. # All partials shown: # #======================================= Start End Mol_Weight Cterm Nterm Sequence 1 318 34112.487 . . MSSTSSPVTTDSQPASVPATGPTKGAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVKE 1 317 33983.445 . E MSSTSSPVTTDSQPASVPATGPTKGAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVK 1 305 32735.815 . Y MSSTSSPVTTDSQPASVPATGPTKGAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQK 25 318 31797.392 K . GAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVKE 25 317 31668.350 K E GAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVK 35 318 30664.698 K . HVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVKE 35 317 30535.655 K E HVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVK 25 305 30420.720 K Y GAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQK 42 318 29893.248 K . RSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVKE 42 317 29764.205 K E RSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVK 35 305 29288.026 K Y HVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQK 42 305 28516.575 K Y RSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQK 1 255 27331.837 . D MSSTSSPVTTDSQPASVPATGPTKGAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLK 71 318 26761.339 K . TQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVKE 71 317 26632.296 K E TQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVK 71 305 25384.666 K Y TQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQK 25 255 25016.742 K D GAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLK 35 255 23884.048 K D HVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLK 42 255 23112.598 K D RSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLK 71 255 19980.689 K D TQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLK 136 318 19731.733 K . FTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVKE 136 317 19602.690 K E FTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVK 142 318 19054.379 K . RAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVKE 142 317 18925.336 K E RAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVK 136 305 18355.060 K Y FTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQK 1 169 17889.722 . M MSSTSSPVTTDSQPASVPATGPTKGAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSK 142 305 17677.707 K Y RAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQK 170 318 16240.776 K . MGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVKE 170 317 16111.733 K E MGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVK 25 169 15574.627 K M GAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSK 1 141 15076.119 . R MSSTSSPVTTDSQPASVPATGPTKGAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGK 170 305 14864.104 K Y MGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLKDPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQK 35 169 14441.933 K M HVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSK 1 135 14398.765 . F MSSTSSPVTTDSQPASVPATGPTKGAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAK 42 169 13670.482 K M RSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSK 136 255 12951.083 K D FTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLK 25 141 12761.024 K R GAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGK 142 255 12273.729 K D RAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSKMGLTDTPWAVIIPSLVSPFGLYLMWVFATEAIPVELLEAARIDGAGEVRTFFQVALPLLAPGIVTVLLFTTVATWNNYFLPLIMLK 25 135 12083.670 K F GAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAK 35 141 11628.330 K R HVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGK 35 135 10950.976 K F HVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAK 42 141 10856.879 K R RSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGK 71 169 10538.573 K M TQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSK 42 135 10179.526 K F RSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATKTQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAK 71 141 7724.970 K R TQEGLADSSGLWFAHDFALWDNISQTFTYDDGIFVRWLLNTLLYVVLGAGGATLLAILGGYALAKFTFPGK 1 70 7369.159 . T MSSTSSPVTTDSQPASVPATGPTKGAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATK 256 318 6798.661 K . DPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVKE 256 317 6669.618 K E DPDWYPLTLGLSAWNAQAETIGGDVIFNLVITGSLLTIVPLIIAFLLLQKYWQSGLAAGSVK 25 70 5054.064 K T GAPRLRTPRKHVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATK 1 41 4237.250 . R MSSTSSPVTTDSQPASVPATGPTKGAPRLRTPRKHVPGRPK 35 70 3921.370 K T HVPGRPKRSVPLTLLTGLVLLYTLVPLAWLVISATK 136 169 3508.967 K M FTFPGKRAVFAVVIGAVAVPGTALAVPTFLMFSK 1 34 3465.800 . H MSSTSSPVTTDSQPASVPATGPTKGAPRLRTPRK 25 41 1922.155 K R GAPRLRTPRKHVPGRPK #--------------------------------------- #---------------------------------------